美利体育登录入口官网:CSA W214-2021
环境 DNA（eDNA）报告要求和术语
Environmental DNA (eDNA) reporting requirements and terminology
- 标准号
- CSA W214-2021
- 发布
- 2021年
- 国际标准分类(ICS)
- 07.080 生物学、植物学、动物学
- 总页数
- 31页
- 发布单位
- 加拿大标准协会
- 当前最新
- CSA W214-2021
- 引用标准
- ISO/IEC 17025:2017
- 本体
- 环境DNA 高通量测序
- 适用范围
- CSA W214:21 环境DNA (eDNA) 报告要求和术语。本标准适用于报告进行eDNA生物调查或评估的信息。它提供了eDNA研究中常用术语的定义，以及在质量保证/质量控制背景下eDNA研究的最小报告要求，包括：调查项目目标和目标、调查设计、元数据收集、从环境中收集的不同类型基质、样本采集、标记、处理和保存、核酸（即DNA和RNA）的提取、各种分析方法（qPCR、 metabarcoding、宏基因组学、宏转录组学等）、总体调查分析和解释，以及评估I类（假阳性）和II类（假阴性）错误的可能性或概率。
| 术语 | 描述 |
|---|---|
| 阴性对照 Negative control | 一种不包含目标美利体育登录入口官网类群eDNA的独立样本（例如，未受污染的蒸馏水），在工作流程的某个阶段（如现场、DNA过滤和提取、PCR）中包含。旨在验证如果样本中实际上不存在目标类群的eDNA，工作流程不会错误地美利体育登录入口官网到它。 |
| 阳性对照 Positive control | 一种独立的样本、样本补充剂或工作流程的固有组件，旨在当样本被分析时产生阳性美利体育登录入口官网结果。旨在验证如果样本中实际上存在目标类群的eDNA，工作流程能够美利体育登录入口官网到它。 |
| 污染 Contamination | 将目标eDNA无意引入到原本未包含该eDNA的具体环境位置和样本中。这可能发生在采集、处理、保存、加工或分析的任何一个阶段，并导致假阳性错误。 |
| 假阴性错误 False negative error (Type 2 error) | 一种数据报告错误，当目标物种DNA存在时，结果错误地指示为阴性（未美利体育登录入口官网到）结果。 |
| 假阳性错误 False positive error (Type 1 error) | 一种数据报告错误，当目标物种DNA不存在时，结果错误地指示为美利体育登录入口官网到目标。 |
| 扩增子序列变体 Amplicon sequence variant (ASV) | 在PCR和HTS期间去除错误序列后恢复的单个DNA序列。这使得ASV能够通过单个核苷酸的变化区分序列变异。 |
| 环境样本 Environmental sample | 从周围环境收集的介质，包括水、土壤、沉积物、空气、木头、粪便或环境中出现的其他表面，目的是分离核酸。 |
| 美利体育登录入口官网限 Limit of detection (LOD) | 在定义的置信水平下能够美利体育登录入口官网到的分析物的最低量。 |
美利体育登录入口官网: CSA W214-2021 中提到的仪器美利体育官网首页网址
| 实时聚合酶链反应仪 qPCR仪器 | 用于扩增目标分子（DNA或cDNA）并美利体育登录入口官网目标分子丰度的生化技术美利体育官网首页网址，可追踪PCR过程中的扩增。 |
| 高通量测序仪 HTS平台 | 用于进行高通量测序，通过比较从环境/生物样本中分离和测序的DNA条形码与标准化参考数据库来进行分类鉴定的美利体育官网首页网址。 |