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美利体育登录入口官网:NACE Paper 09445-2017
解释微生物腐蚀的组学数据:从海水注入系统案例研究中吸取的经验教训

Interpreting Omic Data for Microbially Influenced Corrosion: Lessons from a Case Study Involving a Seawater Injection System


标准号
NACE Paper 09445-2017
发布
2017年
总页数
12页
发布单位
美国防腐工程师协会
当前最新
NACE Paper 09445-2017
 
 
 
 
本体
微生物腐蚀

标准名称:Interpreting Omic Data for Microbially Influenced Corrosion

适用范围: 本研究通过案例分析,讨论了宏基因组学和蛋白质组学技术在微生物影响腐蚀(MIC)中的应用。重点在于如何理解数据生成方法、数据分析质量和解释时可能遇到的限制。具体包括: - 对疑似发生MIC的海水注入系统中猪皮囊残片和水样进行16S rDNA基因扩增与非扩增测序。 - 使用不同数据库(2013年版 vs 2015年更新版)对数据进行分析,结果显示使用不同版本的数据库会对结果产生显著影响。 - 利用蛋白质组学信息确认特定微生物的存在及其表达基因的丰度。

术语描述
寡核苷酸序列
Oligonucleotide sequence
在此上下文中指用于宏基因组分析中识别特定微生物的短DNA片段序列,如16S rDNA序列。
引物扩增
Gene amplification
通过PCR技术特异性地增加目标DNA片段(如16S rDNA)数量的过程,用于提高美利体育登录入口官网灵敏度。
金属还原
Metals reduction
微生物将金属离子还原为低价态或单质金属的代谢过程,是微生物腐蚀的关键机制之一。
硫酸盐还原
Sulfate reduction
微生物将硫酸盐还原为硫化氢的代谢过程,产生的硫化氢可导致严重的点蚀。
硝酸盐还原
Nitrate reduction
微生物将硝酸盐逐步还原为亚硝酸盐、一氧化氮、氧化亚氮或氮气的代谢过程。

美利体育登录入口官网: NACE Paper 09445-2017 中提到的仪器美利体育官网首页网址

Covaris S220 超声破碎仪

S220
用于将基因组DNA片段化至约350碱基对,是宏基因组文库制备的关键美利体育官网首页网址。
Illumina MiSeq 测序仪

MiSeq
用于进行高通量配对末端测序(250 bp读长)的仪器,执行全基因组和16S rRNA测序。
TripleTOF 5600 质谱仪

5600
四极杆飞行时间质谱仪,用于蛋白质组学分析中的液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)美利体育登录入口官网。

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